Методы очистки, которые можно использовать для коллагена, включают высаливание, диализ, центрифугирование, электрофорез и хроматографию, из которых наиболее часто используются высаливание, центрифугирование и электрофорез. Поскольку трудно полностью отделить и очистить коллаген одним методом, фактическая операция заключается в достижении цели разделения и очистки коллагена комбинированным методом. Метод высаливания обычно использует высокую концентрацию NaCl; метод центрифугирования обычно использует препаративную низкотемпературную ультрацентрифугу; метод электрофореза в основном использует электрофорез в полиакриламидном геле с додецилсульфатом натрия (SDS-PAGE), который можно использовать для обоих коллагенов. Его также можно использовать для определения относительной молекулярной массы молекул коллагена. Например, некоторые люди используют трехэтапный метод измельчения, энзимолиза и высаливания, чтобы очистить коллаген I типа из сунитовской овечьей кости. Неколлагеновые вещества в костях сначала удаляли, а затем к осадку добавляли 10% пепсина, вываривали при 4 градусах в течение 24 часов и центрифугировали при 14,000 об/мин в течение 40 минут. Удалите осадок и добавьте NaCl в супернатант, чтобы конечная концентрация достигла 0,9 моль/л, оставьте на ночь, а затем отцентрифугируйте. Конечным осадком является коллаген I типа.
